研究方向为人类蛋白质组的生物信息学，系统生物学。参与863,973及国家自然科学基金课题的研究。负责国家973课题一项。建立了世界上最大的人类蛋白质组数据及数据管理平台，对人类肝脏蛋白质组进行了系统的生物信息研究，包括蛋白质鉴定、修饰、定位、相互作用网络、代谢通路等，正在进行肿瘤标志物发现的研究。发表SCI论文二十余篇，主编、主审专著两部、参编多部。获国家科技进步成果三等奖一项，北京市科学技术进步一等奖一项，军队科技进步成果二等奖两项。生物信息学综合数据库及平台建设、蛋白质组海量复杂数据管理、人类蛋白质表达谱研究、蛋白质相互作用网络研究、生物质谱的信息学研究、翻译调控规律的研究，以及肝脏的系统生物学研究。
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