TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会2月线上会议宣传图
TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会
2022年2月18-20 腾讯网络会议
背景简介：
2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目，批助金额总计441310万元。其中面上项目数量占45%，金额占57%；青年科学基金项目数量占43%，金额占20%。
初步统计，这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中，与通路（pathway）关联的有1349项，金额4.89亿；与miRNA相关的有630项，金额2.3亿；与lncRNA相关的有395项，金额1.45亿；
如何获得有创新意义的疾病靶标基因（mRNA，Protein，lncRNA，circRNA，miRNA，Mutation等）是项目申请及文章写作时最常见的问题。基于这个目的，我们开展了该培训班：TCGA&GEO高通量数据挖掘。癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向（含30000个样本）的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加！另外，其他疾病的研究可以通过GEO数据库进行。
| 项目类型 | 题目 | 金额/万元 |
| 重点项目 | FXYD3介导的信号网络对肠道黏膜免疫稳态的调控研究 | 300 |
| 重点项目 | 基于蛋白-蛋白相互作用精准调节转录因子Nrf2活性及探索其作为肝细胞癌治疗的新靶标 | 298 |
| 重点项目 | miR-23b/24-1簇防治烧伤后脓毒症所致MODS的系统研究 | 297 |
| 面上项目 | LZTR1基因突变导致的RAS/MAPK通路过度激活以及Noonan综合征相关肥厚型心肌病的机制研究 | 60 |
| 面上项目 | SUGP2基因及其突变在遗传性血色病中的致病作用及其机制研究 | 60 |
| 面上项目 | WDR73基因突变在Galloway-Mowat综合征中的致病机制研究 | 60 |
| 面上项目 | STAG2通过ERK/AKT/GSK3β/c-Myc反馈通路调节甲状腺癌谷氨酰胺代谢的机制研究 | 60 |
| 面上项目 | LncRNA FOXF1靶向调控动力相关蛋白1表达在缺氧诱发肺动脉内皮细胞焦亡中的作用及分子机制 | 55 |
会议预期：
通过三天的学习，我们了解生信分析思路对项目及文章的帮助，以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。
讲师简介：宋伟博士
成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
培训经历：在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场培训班。
主办方：上海循掘生物科技中心
会议时间：2022年2月18-20日（2天2晚）
18日 晚上19:00-22:00
19日 白天9:00-18:00 晚上19:00-22:00
20日 白天9:00-18:00
会议地点：线上：腾讯网络会议室，
注意事项：必须使用win7以上系统的电脑，现场不得录音录像。上课软件为Cytoscape，Heml，GSEA，R和Rstudio。
另外需安装腾讯会议软件。