侯廷军，湖南常德人。1997年北京大学化学与分子工程学院获理学学士学位，保送本校化学与分子工程学院硕博连读，2002年获得博士学位。攻读博士学位期间，在徐筱杰教授的指导下从事化学信息学和计算机辅助药物设计方面的研究，论文题目《计算机辅助药物分子设计方法研究》。2002年至2004在北京大学化学与分子工程学院从事两年博士后研究；之后在加州大学圣迭戈分校化学与生物学系从事生物信息学和计算生物学研究。2009.2至2012年加入苏州大学功能纳米与软物质（材料）实验室，被聘为教授，博士生导师。2013年3月至今：浙江大学药学院，教授、博士生导师。
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