黄昆教授1996年毕业于北京清华大学获得生物科学技术与电子计算机双学士学位。分别于1998、2000和2002 年于美国伊利诺伊大学厄尔巴纳-尚佩恩分校（University of Illinois at Urbana-Champaign, UIUC) 获得生理学硕士、电子工程学硕士和数学硕士学位，并于2004年于UIUC获得电子与计算机工程学博士学位。黄昆教授目前是俄亥俄州立大学（The Ohio State University) 医学院基因信息学（Genome Informatics）副院长、生物医学信息学系 (Department of Biomedical Informatics) 教授；他同时还是俄亥俄州立大学生物信息学和计算生物学部门主任以及生物信息共享资源高级顾问。他的研究兴趣包括生物信息学、计算生物学、生物图像信息学和机器学习，他是超过150篇重要学术论文的共同作者。
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