会议简介:
众所周知,R软件是用来做数据分析和作图的软件。一篇高质量的文章,需要好的原始数据、逻辑的分析思路、漂亮的结果、创新的结论。其中,批量的分析操作会提高效率,美观的图片会让人眼前一亮,刮目相看的。相同的数据,做出来的图片可能大相径庭。
R语言特点及优势
可以用来做生信分析及作图的数据库database、在线工具web-service、软件software有很多,其中R软件是一种适应性最广、上手最快的工具。可能有的人会有疑问,R语言是一种编程语言,我没有任何计算机的基础也适合使用R吗?
答案是可以的。原因是R软件做分析及作图,都有比较现成的R包及代码。比如转录组分析相关的R包及代码,可以用来做差异分析、火山图、热图、PCA图、WGCNA等。比如单细胞测序数据分析相关的R包及代码,可以用来做细胞分型及聚类。还有RNA甲基化分析相关的、蛋白组代谢组相关的、临床统计分析相关的R包及代码。
零基础的是怎么快速掌握呢?以一个做热图的代码为例子,虽然每个人的数据是不同的,但是只要拿到了做热图的代码,我们就可以只是简单的修改其中几个参数,就可以轻松作出热图!我们只需要记住那几个关键参数的含义及修改即可,而且,代码中还有详细的中文注释!
当然,如果是我们自学就要花费更多的时间了。所以,我们开设了这次R语言实操班。可以通过老师系统的整理各个方向的生信代码及实操,在短短的两天一晚时间系统的掌握R分析的各种实操
有很多学员也参加过医药加的其他培训班,比如单细胞、比如RNA甲基化、TCGA、多组学、非编码RNA等,它们也有一些R的操作及代码。我们这次也会系统性的对这些班中的R代码进行教学演练,希望大家带着问题解决问题。
专家简介:宋博士
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
会议预期:通过2天1晚的学习的手把手教学让学员掌握R软件下载安装、Rstudio用法、R语言常用作图、R语言数据处理方法与编程技术、掌握R语言自主学习实践的方法与技巧,现场解答学员在实际工作中遇到的有关技术问题,让学员更好地掌握相关技术的应用。另外,课后学员有感兴趣的图片,老师也可以提供相应的R代码。
总体思路是根据生信相关的SCI热点文章为主题,完成里面相关的分析及作图。该培训适用于对生信分析或者医学统计学分析感兴趣,编程零基础及以上的学员参加。