众所周知,可以用来做生信分析及作图的数据库database、在线工具web-service、软件software有很多,其中R软件是一种适应性最广、上手最快的工具。本次学习通过手把手教学让学员掌握R软件下载安装、Rstudio用法、常用医学统计学算法模型R实现、R语言常用作图、R语言数据处理方法与编程技术、掌握R语言自主学习实践的方法与技巧,现场解答学员在实际工作中遇到的有关技术问题,让学员更好地掌握相关技术的应用。另外,课后学员有感兴趣的图片,老师也可以提供相应的R代码。
本次会议同样适合R语言零基础学员,因为R软件做分析及作图,都有比较现成的R包及代码。比如转录组分析相关的R包及代码,可以用来做差异分析、火山图、热图、PCA图、WGCNA等。比如单细胞测序数据分析相关的R包及代码,可以用来做细胞分型及聚类。还有RNA甲基化分析相关的、蛋白组代谢组相关的、临床统计分析相关的R包及代码。以一个做热图的代码为例子,虽然每个人的数据是不同的,但是只要拿到了做热图的代码,我们就可以只是简单的修改其中几个参数,就可以轻松作出热图!我们只需要记住那几个关键参数的含义及修改即可,而且,代码中还有详细的中文注释!
R语言数据分析实战技术(网络)研讨会6月线上培训班
总体思路是根据生信相关的SCI文章为主题,完成里面所有的分析内容。该培训适用于对生信分析或者医学统计学分析感兴趣,编程零基础及以上的学员参加。
会议日程
(最终日程以会议现场为准)
课程
主 要 内容
第一天
上午
R语言——编程环境、数据结构、语法和练习
R软件的历史、简介、优缺点
R编程形式与资源
R软件的安装
Rstudio使用技巧及安装
R语言的数据结构
R语言的编程方法
一起练——R语言的编程练习
第一天
下午
生信参考文献解读
生信文献的流程解读
常用的生信分析流程
流程模块使用的R包及函数简介
案例展示
常用R函数
统计编程思想与流程
数据描述性分析R实现
统计分析R实现
实战操作演练——卡方检验、回归分析、方差分析、Fisher精确检验、相关性分析等
第一天
晚上
常用R包(1)
R包的安装
芯片数据预处理——标准化,归一化
差异分析——计算差异倍数,T检验,火山图
聚类分析——PCA分析,热图分析
第二天上午
常用R 包(2)
R语言功能富集分析,功能条形图,功能气泡图
共表达分析——pearson法,相关性散点图
生存预后分析——KM曲线图,添加p值,HR值
实操
第二天下午
常用R包(3)
单细胞测序相关分析
RNA甲基化相关分析
时间序列分析——多组连续样本的基因表达聚类
实操
R语言学习的方法与技巧
算法思想、R包及函数用法、参数说明、范例程序
如何找到有用的R资源
R语言学习小窍门
互动环节与答疑
会议嘉宾
(最终出席嘉宾以会议现场为准)
专家简介:宋博士
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
会议预期:通过该培训,可以学会R语言基础(输入文件格式、输出文件格式、操作代码的参数调整)、统计学上各种算法的实现、SCI常用图片生成
在线报名:https://www.huodongjia.com/event-1170572648.html